日前,QG刮刮乐携手承启生物,基于承启生物自研FANse算法,乐成以不输国际主流处置惩罚器平台的速率,在开先KX-6000系列处置惩罚器平台上运行了高性能剖析大规�;虿庑蚴�。该效果的顺遂告竣意味着精准医学基因测序领域的纯国产流程得以实现,并资助我国在生物学研究、遗传病诊断、盛行病溯源等领域进一步强化底层基础,赢取高质量生长的自动权。
携手立异 破局大规模测序“卡脖子”难题

大规模测序,又称新一代测序、二代测序,是指将DNA或RNA打断成许多小片断举行平行测序,一次测序即可获得几百万至几亿个小片断的核酸片断序列信息,在生物学研究、疾病诊断、盛行病溯源等领域有着普遍的应用。
但在这个历程中爆发的海量数据必需经由大宗运算才华获得具有生物学意义的结论,通常需要很强算力的盘算机或效劳器破费数小时才华给出效果。然而,高性能CPU和GPU高度依赖入口,让业内不得不爆发被外洋断供“卡脖子”的忧虑,并且,关于一些对清静性有极高需求的领域,使用非自主CPU开展基因测序尚有可能保存泄密的危害。

承启生物一直深耕生物信息国产化处置惩罚手艺,自研的纯国产高性能大规模测序比对算法FANSe率先实现了规�;逃�,该算法可以凭证差别CPU的特征举行针对性优化,2020年还曾创下单机5分钟剖析完一个30X人全基因组测序数据集的天下纪录,并一直坚持至今。
大规模测序应用体现追平国际主流

QG刮刮乐携手承启生物,针对QG刮刮乐开先KX-6000系列8核处置惩罚器平台国产盘算机和非国产效劳器举行了大规模测序性能测试。两款装备均安排于承启基因测序剖析云平台,使用FANSe算法,在常见的转录组、翻译组、细菌菌群宏基因组等应用中,8核8线程,CPU主频2.7GHz的国产盘算机的现实应用体现与非国产高性能效劳器(双路E5V3,28核56线程)基内情当,最小差别仅1%。在大规模测序数据处置惩罚应用上,国产盘算机的现实应用性能第一次险些追平了国际主流效劳器。
此前,承启生物团结相助同伴宣布了国产大规模测序的全流程,致力于将测序仪、试剂、剖析算法等周全实现国产化。自研的FANSe算法在纯国产整机上乐成运行,标记着我国基因测序的清静性和自主性抵达一个全新的高度,同时也标记着国产盘算机不但能支持诸多精准医学应用,更在磨练检疫、盛行病控制、生物战防治、法医判断等直接关系到国家清静的领域拥有了大显身手的能力与空间。
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